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核酸電泳分析方法比較

更新時(shí)間:2024-04-28點(diǎn)擊次數(shù):1167

      凝膠電泳仍然是核酸分離和分析的既定方法。然而,許多使用預(yù)制凝膠和標(biāo)準(zhǔn)化試劑的自動(dòng)化系統(tǒng)現(xiàn)在非常流行。這種方法在有大量樣品或需要高通量分析的情況下特別有用。此外,還開發(fā)了安捷倫生物分析儀等系統(tǒng),無需制備電泳凝膠。它們采用在包含互連微儲(chǔ)器的小型盒單元上構(gòu)建的微流體電路。將樣品涂在一個(gè)區(qū)域,并在計(jì)算機(jī)控制的電泳下驅(qū)動(dòng)通過微通道。這些通道通向儲(chǔ)液器,例如允許與其他試劑(例如染料)一起孵育的時(shí)間。因此,電泳分離以微米級(jí)形式進(jìn)行。小樣本量減少了樣本和試劑的消耗,并且由計(jì)算機(jī)控制的裝置允許在很短的時(shí)間內(nèi)捕獲數(shù)據(jù)。

天能水平電泳槽.jpg

   此外,專用分光光度計(jì)(例如 ThermoFisher Scientific NanoDrop 系統(tǒng))可以在有限的樣品量下快速提供核酸濃度。替代分析方法,包括基于高效液相色譜的方法,已經(jīng)越來越受歡迎,尤其是 DNA 突變分析。傳統(tǒng)上用于蛋白質(zhì)分析的質(zhì)譜方法,例如基質(zhì)輔助激光解吸/電離 (MALDI-TOF),由于其速度快且可靠性不斷提高,也越來越多地用于核酸分析。小樣本量最大限度地減少了樣本和試劑的消耗,并且由計(jì)算機(jī)控制的裝置允許在很短的時(shí)間內(nèi)捕獲數(shù)據(jù)。此外,專用分光光度計(jì)(例如 ThermoFisher Scientific NanoDrop 系統(tǒng))可以在有限的樣品量下快速提供核酸濃度。

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單細(xì)胞DNA分析

    單細(xì)胞 DNA 分析也是近年來許多研究的焦點(diǎn)。熒光激活細(xì)胞分選(FACS)、激光捕獲顯微切割(LCM)和微流體分析等技術(shù)極大地提高了這些細(xì)胞的分析能力。最近已經(jīng)采用了許多商業(yè)方法,一個(gè)例子是 10x Genomics 開發(fā)的工藝。這使得一種有趣且新穎的自動(dòng)化過程成為可能,稱為 10x Chromium,可以使用 Illumina HiSeq 系統(tǒng)通過測序來制備、條形碼化和分析來自數(shù)千個(gè)細(xì)胞的核酸,以進(jìn)行單細(xì)胞基因表達(dá)譜和表征(參見第 1.8.6 節(jié))。諸如此類的新流程提供了有效的方法來對健康和患病狀態(tài)下的細(xì)胞和組織進(jìn)行有效的進(jìn)一步分析。

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